１、养殖场沙门菌的污染情况 养殖场是鸡产业链上游环节，了解养殖场沙门菌的流行规律可有效控制沙门菌沿产业链传播。 2016年欧洲国家报道的农场沙门菌的流行率为2.6%。在加利福尼亚沙门菌的流行率仅为1.19%。在其他拉丁美洲国家，也报道了农场层面的低沙门菌流行率：巴西的一项研宄报告了农场沙门菌的污染率为5%；有学者对埃塞俄比亚４８个家禽养殖场进行沙门菌污染情况的调查，发现７个农场的样本中均能检出沙门菌，检出率为4.7%，圣保罗沙门菌为常见血清型，其次为鼠伤寒沙门菌、肯塔基沙门菌等。 2006-2012年，Gong等从中国12个省７个地区的51个养鸡场的3566份直肠拭子样品中分离到323株沙门菌，鸡养殖环节沙门菌的总体流行率为9.8%，鸡白痢（17.0%％）、鼠伤寒（15.5%）和肠炎沙门菌（12.1％）最为常见。Lei等的调查中显示种鸡场沙门菌污染率为5.3%，孵化场为4.2％，商品鸡场为10.4%，肠炎沙门菌为主要的血清型。不同程度的沙门菌污染可能与地区、养殖环境等有关。 ２、鸡蛋和蛋制品中沙门菌的污染情况 由于食用未煮熟的鸡蛋产品往往与沙门菌暴发有关，鸡蛋和鸡蛋制品的沙门菌污染成为一个主要的公共卫生问题。然而，不同地区基于鸡蛋流行率的研宄存在较大的差异。李卓阳Ｍ在2016年9月至-2018年10月期间对江苏省５个市县的鸡蛋和蛋制品样品进行采集，沙门菌分离率为7.9%，其中肠炎沙门菌为优势血清型；李文娟等于2014年３－４月从成都市区和郊县多个大型超市、农贸市场采集鸡蛋进行沙门菌的流行调查，总污染率为40％，肠炎沙门菌为流行菌株。李晓晶？的调查显示，武汉市售鸡蛋中沙门菌的检出率为7.1％。董睿对陕西地区鸡蛋源沙门菌进行调查，检出率为５％。尹晓楠等Ｗ对北京郊区散养鸡及新鲜鸡蛋进行沙门菌带菌情况调查，调查显示蛋沙门菌平均阳性率为33.3%。不同地区沙门菌的流行率有所差异，可能与养殖场的规模和鸡蛋的收集、储存、运输途径等有关。 美国食品和药物管理局（FDA）指出，美国每年因食用受沙门菌污染的鸡蛋而引起的病例高达79，000例，死亡病例为30例。自２０世纪９０年代初以来，美国和日本的液体鸡蛋产品中沙门菌污染率分别为20％和10－20％；在1985年至2002年间，CDC报告的美国沙门菌病例中，有53％是由鸡蛋污染引起的。Sodagari等调查西澳大利亚生产和销售的零售鸡蛋中非伤寒沙门菌污染率，11.5%的受检鸡蛋样品呈沙门菌阳性，其中主要的血清型是鼠伤寒和婴儿沙门菌。值得注意的是，在有些关于鸡蛋的调査中，从鸡蛋中没有分离出沙门菌，但是鸡蛋和生鸡蛋产品仍然与沙门菌爆发有关。 ３沙门菌耐药性和酎药基因 长期以来，非伤寒沙门菌抗生素耐药性的增强在很大程度上归因于畜牧业中抗生素的使用，这给预防工作带来很大挑战。在过去几十年里，出现了高毒力和高抗药性的沙门菌，导致了人类更高的发病率和死亡率。同时在食用动物中也出现了几种对多种抗生素具有抗药性的沙门菌血清型，突显了一个重大的食品安全危险问题。同时，家禽产业链中沙门菌日益严重的耐药性和多重耐药率也给养殖业以及食品业带来巨大的经济损失。 许多国家己经建立了监测抗生素耐药性和其他细菌的系统，最早进行这些工作的是欧洲和美国。在欧洲，2014年抗生素耐药率调査结果显示沙门菌对四环素类的耐药率最高（30.3％），其次是磺胺类（28.6％）和氨苄青霉素（28.2％），对头孢菌素的耐药率为1.1%左右。然而，不同国家的抗生素耐药率存在差异，例如，葡萄牙对环丙沙星的耐药率为0.0%，马耳他为50.0%；丹麦的萘啶酸耐药率为5.3%，匈牙利为37.3%。 这种差异可能归因于某些耐药沙门菌菌株在特定国家的克隆。此外，26.0%的沙门菌表现为多药耐药表型。来自美国国家肠道细菌耐药性监测系统（NARMS）的报告中显示，2013年，共调査的2178株来自人类的沙门菌分离株中对各类抗菌药的耐药率在0.5%到12.6％之间，其中对四环素（12.6％）、链霉素（11.5％）、氨苄育霉素（10.4%）和磺胺类（10.3％）等较老的抗菌药的耐药率更高，少数菌株对萘啶酸、氟喹诺酮类、第三代头孢菌素等抗生素耐药；此外9.8％的细菌表现为多重耐药的特征。Christian等网对某肉鸡生产链进行沙门菌的调査和药敏试验，结果表明97％的菌株对至少一种抗生素表现出抗药性，100％的分离株对环丙沙星和萘啶酸耐药。 在我国，家禽养殖过程中由于抗生素的过度使用，导致细菌多重耐药率的升高以及食品中的药物残留。Ｋｕａｎｇ等对我国中部（河南、湖北、湖南）地区的鸡（ｎ＝837）、猪（ｎ＝930）和奶牛（ｎ＝418）源沙门菌分离株进行了耐药性测定得知，48.1４％的分离株对至少一种抗生素耐药，34.7％对三种以上药物耐受，对磺胺甲恶唑－甲氧苄啶（39.6％）、萘啶酸（39.2％）等耐药率相对较为严重。Bai等调査和分析了中国沙门菌病患者和食品类动物印第安纳沙门菌分离株的耐药流行特征，菌株均对氨苄青霉素、头孢噻肟、头孢他啶和环丙沙星耐药，对美罗培南敏感，87.2％的菌株表现为多重耐药。Ｗａｎｇ等对我国８个省份的沙门菌分离株进行药物敏感性分析，结果表明磺胺类和四环素类耐药率最高，且70.2％的菌株表现为多重耐药。许云敏的耐药检测结果表明临床样品中的沙门菌分离株对氨苄西林耐药率在33.3％－64.8％间，对头孢类、环丙沙星的耐药率分别为0-5.3%、2.4％－14.3％，多重耐药率平均为3.9％。倪佳琳等的研宄中发现肠炎沙门菌对萘啶酸的耐药率高达93.3％－100.0％，对庆大霉素、四环素的耐药率分别在６％和20％之间，链霉素、氨苄西林等常用抗生素的耐药率缓慢上升且均大于50％。耐药基因的水平传播在肠道沙门菌的耐药性中占有不可或缺的部分，这些抗性基因可以在抗性质粒或细菌的染色体中找到。在沙门菌中己鉴定出多种耐药基因，迄今为止，常见的耐药基因有氟喹诺酮类，喹诺酮类，Ｐ-内酰胺类，氨基糖苷类，四环素类，磺胺类等。 PCR方法检测鸡源沙门菌分离株的耐药基因，发现在头孢菌素耐药表型分离株中唯一发现的耐药基因是WacTX-M（59％），其中Wacxx-M＿65菌株30株，Wf1CTX.M-14菌株８株。 强斌对156株沙门菌基于全基因组进行耐药性分析，结果显示菌株中常见的基因为blaTEM-1/strAB、sul2、tetA其他耐药相关基因均是少量存在。 鉴于日益严峻的细菌耐药形势，美国ＦＤＡ发布了最终规则，在生产中逐步淘汰抗生素，限制生产中临床相关类抗生素的使用，并要求兽医监督食用动物和家禽中用于治疗目的抗生素的使用。为了应对这种情况，大量干预措施，诸如益生菌、植物生物素和其他替代品正在针对抗药性病原体进行测试。但大多数研宄都处于初步阶段，确定、优化和扩大这些干预措施，使其达到过去几十年抗生素所提供的效力和安全性水平，将是一项重要的任务。 4、养殖场沙门菌防控措施 鉴于鸡产业链的不同环节均能分离到沙门菌且沙门菌耐药率逐渐升高，因此需要寻找安全有效的生物替代手段针对不同环节进行沙门菌的防控，降低沙门菌对种鸡养殖业的危害。 防止产业链沙门菌污染的首要举措就是控制源头污染，确保种鸡群无沙门菌感染。在养殖过程中，首先要保证种鸡群无沙门菌病，避免引进携带沙门菌的雏鸡，种蛋入孵前应该充分多次消毒保证孵化中心的无菌。其次，在大多数家禽日常养殖过程中一定要做好多种预防工作，安全和卫生是防止感染性入侵的最有效的措施。 养殖场内一旦感染沙门菌病很难清理，因此可以采取以下措施：在鸡场周围建造绿色隔离带以限制人员和其他动物的活动；对鸡舍环境、饲养设备及外环境定期消毒灭菌处理；鸡舍必须防止啮齿类动物进入，并定期捕杀；鸡只饮用水需经过严格纯化和消毒处理；饲养场进出入口应该设置消毒池和消毒设施对饲料进行灭菌处理等。此外，世界各地的研宄人员一直在努力研制和寻找用于家禽生产的抗生素替代品。为了减少沙门菌在鸡体内定植的发生率，接种疫苗和消毒等预防措施对于减少沙门菌污染和感染的可能性至关重要。除此之外，人们己经制定了许多新型预防策略，如益生菌、噬菌体疗法等。